灵魂宝石在很多作品中被描绘为储存和代表个体灵魂的容器。例如,在《魔法少女小圆》中,灵魂宝石是魔法少女的魔力之源,同时也是她们自身灵魂的容器。这些宝石由被丘比选中的女孩因契约而产生,是魔法少女存在的证明。当灵魂宝石破碎时,魔法少女便会死亡,因此宝石的完整与否直接关系到魔法少女的生死。
灵魂宝石的作用灵魂宝石还具有一些特殊的用途。在上古卷轴5中,灵魂宝石被用于附魔和给附魔武器充能。通过捕获生物的灵魂并将其收入到灵魂石中,可以使灵魂石具有能量,从而为魔法物品提供足够的能量。而在游戏《奇迹MU》中,灵魂宝石被用作给0-8级的装备提供升级的材料,尽管其成功率只有50%,但在装备带有幸运属性的情况下,成功率可以提升至75%。